期刊简介
中华医学会主办。本刊是国内烧伤学术界惟一的全国性权威刊物，由国内外烧伤外科及相关学科著名专家组成编委会。烧伤的重要问题，通常也是内外科的基本问题。杂志力求充分展示本学科领域的新理论、新技术、新方法、新经验，注重实用性，讲究可读性。全方位展示本专业的研究进展、临床治疗和护理经验，将整形与康复理念贯穿于烧伤救治全过程，将独到的修复技术应用于各种类型的难治性创面。杂志目前已被《Medline》等10多个国际主要数据库收录，具有较大影响。
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首页>中华烧伤杂志
- 杂志名称：中华烧伤杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华医学会
- 国际刊号：1009-2587
- 国内刊号：50-1120/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中华医学会优秀期刊三等奖期刊收录：文摘与引文数据库, 万方收录(中), 医学文摘, CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 维普收录(中), CA 化学文摘(美), 上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 哥白尼索引(波兰)
噬菌体基因组PaP1的鸟枪法测序及其生物信息学分析
谭银玲；李明；黄建军；饶贤才；朱军民；胡福泉
关键词：细菌噬菌体, 基因组, 假单胞菌, 铜绿, 生物信息学
摘要：目的对分离的铜绿假单胞菌噬菌体PaP1进行全基因组测序,并进行初步的生物信息学分析,为噬菌体的改造及其治疗奠定基础.方法采用鸟枪法随机测序和重叠群组装的策略对PaP1进行基因组测序,并通过EditSeq、开放读码框架(ORF)finder、GeneMarkTM、BPROM、FindTerm、Palindromes、Equicktandem及FAStRNA等软件对所获得的基因组序列的一般特征、蛋白质同源性序列及tRNA基因等进行分析和预测.结果PaP1基因组约为90000 bp,其中大重叠群为28 249bp.在已获得序列中预测出120个ORFs、41个推定基因及9个簇集在5'末端的tRNA基因.在41个推定基因中,预测出编码DNA末端酶大亚单位、DNA解旋酶B亚单位、肽聚糖结合蛋白及3个尾丝蛋白等6个基因的功能.结论鸟枪法只能测出噬菌体基因组PaP1的部分序列,重复序列的存在是该基因组测序困难的原因.
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